Письмо Минфина от 13.07.2018 № 03-11-11/48801

Доходы от продажи недвижимости, использовавшейся в бизнесе, предприниматель, совмещающий УСН и ЕНВД, должен включить в УСН-базу.

Причем даже в случае, когда проданное помещение использовалось в деятельности, переведенной на ЕНВД.

Дело в том, что применять «вмененку» можно в отношении только определенных видов предпринимательской деятельности. Например, розничной торговли через магазин с площадью торгового зала не более 150 кв.метров. При этом продажа основных средств (в частности, такого магазина) не может облагаться ЕНВД.
Таким образом, если ИП помимо ЕНВД применяет еще и УСН, то доход от продажи недвижимости, использовавшейся во «вмененной» деятельности, он должен учесть при исчислении «упрощенного» налога.

Обратите внимание, что в данном случае уменьшить доход от продажи за счет понесенных ранее расходов на покупку проданного магазина не получится. Ведь учитывать в УСН-базе можно затраты на покупку только тех ОС, которые использовались в «упрощенной» деятельности.

Источник: сайт Главная книга